Une bataille contre la résistance aux antibiotiques

Postdoc en épidémiologie à l'Institut Pasteur de Paris, Maya Nadimpalli s'est intéressée à la résistance aux antibiotiques chez les jeunes enfants dans les pays à faible revenu. À présent à l’Université Tufts, près de Boston, dans le Massachusetts, Nadimpalli partage les opportunités et les défis liés à l’étude de la santé publique dans les pays en développement.

Décrivez votre approche de recherche.

Ma thèse consistait à expliquer comment l'agriculture à grande échelle et l'utilisation d'antibiotiques pourraient contribuer à l'évolution et à la dissémination de la résistance aux antibiotiques chez l'homme. Lorsque j’ai commencé ma recherche postdoctorale en 2015, j’avais eu l’impression, basée sur des preuves limitées de recherches effectuées aux États-Unis et en Europe, que l’utilisation d’antibiotiques chez les animaux n’affecterait pas les populations humaines. Mais personne n’avait vraiment étudié ce qui se passait dans les pays à faible revenu, mais en développement rapide – en particulier ceux où la consommation de viande et la consommation d’antibiotiques sont en forte augmentation, comme le Cambodge.

Comment êtes-vous venu faire de la recherche au Cambodge?

À l'Institut Pasteur, j'ai travaillé sur le projet Infections bactériennes et maladies résistantes aux antibiotiques chez les jeunes enfants dans les pays à faible revenu au Cambodge, à Madagascar et au Sénégal. Nous voulions déterminer si les femmes colonisées par des bactéries résistantes aux médicaments les transmettaient aux enfants. À Paris en 2013, 6% des personnes en bonne santé sont colonisées par ces souches productrices de β-lactamase – elles sont asymptomatiques, mais ont la bactérie dans leur intestin. En Asie du Sud-Est, cependant, la colonisation est beaucoup plus élevée, plus de 60%. De plus, au Cambodge, le contrôle des antibiotiques les plus répandus est faible, la viande crue sur les marchés est souvent manipulée à la main et la consommation de viande séchée au soleil avec du sel et de la chaux est courante. Mes recherches ont montré que la consommation de viande séchée est un facteur de risque pour l’acquisition de ces bactéries résistantes aux médicaments.

Décrivez la logistique de ce type de recherche.

Il peut être fastidieux de planifier le travail sur le terrain dans différents pays et fuseaux horaires, sans parler des approbations éthiques sécurisées et des autorisations d’expédition, et d’élaborer des protocoles de laboratoire pouvant être réalisés avec des ressources limitées. Par exemple, il est délicat de publier des données sur la résistance aux antibiotiques chez les animaux. Nous avons donc échantillonné des aliments. Nous avons passé des mois à développer les protocoles aux États-Unis et à obtenir toutes les fournitures dont nous avions besoin pour le travail sur le terrain. Dans certains pays, la réception d'un réactif ou d'un kit d'extraction peut prendre trois mois.

Comment cette expérience a-t-elle façonné vos objectifs de carrière?

Je veux continuer à faire de la recherche dans les pays en développement. J'ai rejoint le nouveau centre de gestion intégrée de la résistance aux antimicrobiens de l'Université Tufts. C’est l’un des rares endroits aux États-Unis à être prêt à répondre aux questions d’un point de vue "santé unique" – un concept transdisciplinaire qui reconnaît que la santé des personnes est liée à la santé de l’environnement et des animaux – car elle a école de médecine, une école d'ingénieur et une école vétérinaire. Le centre s'appuie également sur le travail et l'héritage de Stuart Levy, médecin aujourd'hui à la retraite et directeur du Centre Tufts pour la génétique d'adaptation et la pharmacorésistance à la Tufts School of Medicine, qui avertit depuis des décennies des conséquences de la résistance aux antibiotiques. Ma prochaine étape consiste à demander des subventions pour effectuer des travaux de suivi au Cambodge, ainsi que dans des pays à revenu intermédiaire comme l'Inde, où l'agriculture industrielle se développe rapidement. Je suis intéressé par la façon dont les jeunes enfants sont exposés à la résistance aux antibiotiques si tôt, en particulier dans les zones où les pratiques alimentaires évoluent en même temps. Par exemple, certaines femmes allaitent moins et comptent davantage sur le lait maternisé.

Quel est votre conseil pour ceux qui font de la recherche à l’étranger?

Renseignez-vous autant que possible sur la culture de travail et les institutions scientifiques du pays dans lequel vous envisagez de vous rendre – par exemple, comment elles décident quelles questions de recherche méritent d'être explorées, à quel point elles sont ouvertes à la recherche interdisciplinaire et comment établir des collaborations. À mon arrivée en France, le personnel de l'Institut Pasteur a organisé un atelier sur la culture de la recherche à l'intention des étudiants internationaux. La France, par exemple, a une hiérarchie plus formelle que les États-Unis. Les membres du personnel de Pasteur ont clairement indiqué que les nouvelles idées suscitaient un plus grand scepticisme qu'aux États-Unis et nécessitaient un argument entièrement contesté avant d'être acceptées. Il était extrêmement utile de réajuster mon approche et mes attentes pour y travailler efficacement.

Cette interview a été modifiée pour sa longueur et sa clarté.