Un institut de génomique va fermer un centre animalier de premier plan

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Les centres de recherche animale du monde entier utilisent des souches de souris développées à l'institut Sanger.Crédit: Qilai Shen / Bloomberg via Getty

L’un des principaux centres de génomique au monde – le Wellcome Sanger Institute de Hinxton (Royaume-Uni) – a décidé de fermer un laboratoire de 13 ans dédié à la recherche sur les animaux et fournissant des souches de souris à des milliers de chercheurs en génétique dans le monde entier. Mais certains scientifiques craignent que Sanger n’ait trop tarder pour réduire la recherche sur les animaux – et que cette décision limitera la capacité du centre à mener des recherches scientifiques de pointe.

Fondée en 2006 et dotée d'un budget de 30 millions de livres sterling (38 millions de dollars), cette animalerie accueille des souris, des poissons-zèbres, des rats et des grenouilles utilisés à des fins de recherche et emploie environ 70 personnes.

L'institut déclare que la fermeture, annoncée aux employés le 16 mai, est une conséquence du passage à l'utilisation de technologies alternatives, telles que les lignées cellulaires et les organoïdes – structures biologiques 3D pouvant être cultivées dans un plat – dans la recherche en génétique, au lieu d'animaux . Mais les scientifiques de Sanger qui étudient des maladies complexes telles que le cancer, qui nécessitent une compréhension de la manière dont les gènes interagissent dans des organismes entiers, continueront à utiliser des souris dans des laboratoires individuels sur site jusqu'à la fermeture de l'installation en 2022 au plus tard. Ils peuvent également être en mesure d'utiliser des installations pour animaux dans des établissements voisins, tels que l'Université de Cambridge.

«Cette décision a été motivée par la stratégie scientifique de l’institut» et repose sur un examen et des consultations rigoureux, a déclaré le directeur Mike Stratton, qui a informé le personnel de la fermeture.

Impact global

L'institut Sanger est surtout connu pour son rôle dans le décodage du tiers de la séquence de l'ADN humain. L’institut est également bien connu pour le rôle qu’il a joué dans un projet dans lequel les chercheurs ont «détruit» chaque gène du génome de la souris, l’un après l’autre. Il a également créé une bibliothèque de référence sur les génomes des souches de souris couramment utilisées dans la recherche, ce qui permet aux chercheurs du monde entier de déterminer si les mutations découvertes lors d'expériences sont nouvelles ou établies.

La fermeture de l’animalerie reflète la réduction progressive de la recherche sur les animaux à la Sanger au fil des ans, a déclaré Mike Turner, directeur des sciences à la Wellcome Trust de Londres, une organisation caritative biomédicale qui finance la Sanger. La stratégie scientifique de l’institut s’oriente actuellement vers des projets alternatifs, tels que Tree of Life, qui séquenceront les codes génétiques de 66 000 espèces de plantes et d’animaux britanniques. Sanger est également un partenaire international qui créera des cartes de référence de toutes les cellules humaines, explique-t-il.

«La tendance actuelle est de progresser vers in vitro systèmes pour étudier la biologie humaine », reconnaît Ramiro Alberio, biologiste du développement à l'Université de Nottingham, au Royaume-Uni, qui n'a pas été surpris par la fermeture.

Mais la décision a suscité des questions parmi certains scientifiques biomédicaux. Ils craignent que Sanger ne puisse pas rester à la pointe de la recherche en génétique, qui selon eux repose encore sur des expériences utilisant des modèles animaux de maladie.

La fermeture est un "pas de géant en arrière", déclare Robert Weinberg, biologiste du cancer à l'Institut Whitehead pour la recherche biomédicale à Cambridge, dans le Massachusetts, qui utilise des animaux dans ses recherches. «Je suis très surpris de cette décision. Il est prématuré d'une décennie ou deux. Sanger sera à la traîne. "

Il dit que, à mesure que les scientifiques en apprennent davantage sur les processus de maladies, y compris le cancer, ils réalisent de plus en plus que l'analyse du génome à elle seule ne fournira pas toutes les réponses. Les souris sont particulièrement utiles pour étudier des tissus complexes. «Les modèles de souris sont irremplaçables et n'ont pas été évités par des ensembles de données complexes», a-t-il déclaré.

L'animalerie de Sanger est l'une des meilleures au monde, a déclaré Monica Justice, généticienne en biologie moléculaire à l'Hospital for Sick Children de Toronto, au Canada. Justice a déclaré que le centre de Sanger avait été créé pour aider les scientifiques à comprendre ce que font les gènes de souris et que de nombreux programmes de souris dans ce domaine, appelés génomique fonctionnelle, prennent fin parce qu'ils ont progressé. un à Sanger. Mais elle dit que d'autres instituts élargissent leur recherche sur la souris – les modèles de souris sont de plus en plus utilisés par les scientifiques dans la recherche préclinique, par exemple.

Les changements pourraient également dissuader les généticiens souris de travailler chez Sanger, et une telle expertise interne est cruciale pour un programme de biologie de première classe, explique David Beier, généticien du développement à l'Université de Washington à Seattle.

Trouble précédent

Cette fermeture intervient six mois après que les scientifiques de Sanger eurent exprimé leur "grave préoccupation" concernant le bien-être des animaux dans l’établissement dans une lettre au directeur de l’exploitation de Sanger, Martin Dougherty.

Dans la lettre de novembre 2018, une version non signée de La nature Les scientifiques ont constaté que les pénuries de personnel menaçaient les normes de bien-être élevées de l’installation et que le manque de personnel qualifié signifiait que les animaux étaient éliminés car ils ne pouvaient pas être utilisés. Cela enfreint les normes éthiques, ainsi que les exigences définies par le Home Office, le ministère britannique responsable de la recherche animale, indique la lettre. "Les échecs sont tels que nous pensons qu'il existe un risque imminent d'infractions au Home Office et potentiellement de révocations de licences."

Un porte-parole de Sanger a déclaré La nature qu'il a répondu à ces préoccupations, mis en place un programme pour y remédier et en avoir informé le Home Office. La fermeture de l'installation n'est pas liée à des problèmes de bien-être, a déclaré le porte-parole, et le bien-être des animaux est de la plus haute importance pour l'institut.

Allan Bradley, un généticien de la souris qui a travaillé à Sanger jusqu'en novembre 2018 et qui a contribué à la mise en place de l'animalerie, déclare que cette installation est considérée par les scientifiques du monde entier comme un trésor. L’usine a respecté les normes internationales les plus strictes en matière de bien-être animal au cours des 12 dernières années, a déclaré Bradley, également ancien directeur de Sanger.

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